现代医学还发现，木瓜中含有番木瓜碱，有麻醉中枢和抗阿米巴痢疾、抗肿瘤、抗菌和抗寄生虫病等作用，对腓肠肌痉挛有明显的治疗作用，还具有抗淋巴性白血病之功。

食用木瓜还有利于肠胃消化吸收。当你在宴席上，或在家庭用餐时，多食了些蛋类、肉类、牛奶，以及一些不易消化食物时，胃肠感到不舒适，吃些番木瓜后，胃肠不舒适状况就会消失，个中原因就是番木瓜中的蛋白消化酶在起作用，这种酶素能消化蛋白，有利于人体对食物进行消化和吸收，因此有健脾消食之功。还有，吃了太多的肉食，脂肪会堆积在下半身，这时，吃些木瓜后，木瓜里的酵素，会帮助分解肉食，减低胃肠的工作量，让肉感的双腿慢慢变得更具骨感。

青木瓜的籽未成熟是白色的，成熟木瓜的籽是黑褐色的。一般人购买木瓜，都是吃肉弃籽。在日常生活中，极少有直接利用木瓜籽的。可以说，木瓜籽不能吃。但木瓜籽有它的多种用途，可以入药，并可加工成化妆品。另外，木瓜籽含有木瓜酵素会让鲜肉软化，但市场上已经有经过提炼的“嫩肉粉”出售，使用起来比用木瓜籽方便得多。炒着吃富含锌。或者将木瓜子进行深化提取，做美容养颜护肤品。